Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NTF3P20783 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NTF3P20783 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NTF3P20783 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NTF3P20783 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NTF3P20783 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NTF3P20783 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NTF3P20783 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NTF3P20783 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NTF3P20783 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NTF3P20783 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NTF3P20783 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NTF3P20783 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NTF3P20783 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NTF3P20783 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NTF3P20783 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NTF3P20783 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTF3P20783 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTF3P20783 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTF3P20783 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTF3P20783 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTF3P20783 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTF3P20783 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTF3P20783 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTF3P20783 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTF3P20783 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTF3P20783 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTF3P20783 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTF3P20783 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTF3P20783 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTF3P20783 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NTF3P20783 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTF3P20783 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NTF3P20783 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTF3P20783 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NTF3P20783 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NTF3P20783 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NTF3P20783 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NTF3P20783 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NTF3P20783 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NTF3P20783 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTF3P20783 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTF3P20783 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTF3P20783 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NTF3P20783 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTF3P20783 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTF3P20783 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTF3P20783 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTF3P20783 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTF3P20783 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTF3P20783 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTF3P20783 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTF3P20783 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTF3P20783 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTF3P20783 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTF3P20783 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTF3P20783 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTF3P20783 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTF3P20783 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NTF3P20783 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTF3P20783 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTF3P20783 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTF3P20783 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTF3P20783 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTF3P20783 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTF3P20783 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTF3P20783 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTF3P20783 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTF3P20783 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTF3P20783 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTF3P20783 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NTF3P20783 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTF3P20783 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTF3P20783 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NTF3P20783 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTF3P20783 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NTF3P20783 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTF3P20783 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTF3P20783 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NTF3P20783 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTF3P20783 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTF3P20783 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTF3P20783 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTF3P20783 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTF3P20783 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTF3P20783 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTF3P20783 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTF3P20783 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTF3P20783 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTF3P20783 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTF3P20783 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTF3P20783 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTF3P20783 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTF3P20783 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTF3P20783 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTF3P20783 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTF3P20783 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTF3P20783 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTF3P20783 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NTF3P20783 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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