Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms