Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms