Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2CP19387 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms