Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DESP17661 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DESP17661 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DESP17661 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DESP17661 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DESP17661 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DESP17661 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DESP17661 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DESP17661 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DESP17661 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DESP17661 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DESP17661 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DESP17661 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DESP17661 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DESP17661 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DESP17661 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DESP17661 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DESP17661 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DESP17661 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DESP17661 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DESP17661 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DESP17661 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DESP17661 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DESP17661 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DESP17661 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DESP17661 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DESP17661 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DESP17661 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DESP17661 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DESP17661 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DESP17661 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DESP17661 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DESP17661 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DESP17661 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DESP17661 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DESP17661 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DESP17661 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DESP17661 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DESP17661 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DESP17661 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DESP17661 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DESP17661 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DESP17661 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DESP17661 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DESP17661 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DESP17661 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DESP17661 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DESP17661 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DESP17661 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DESP17661 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DESP17661 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DESP17661 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DESP17661 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DESP17661 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DESP17661 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DESP17661 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DESP17661 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DESP17661 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DESP17661 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DESP17661 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DESP17661 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DESP17661 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DESP17661 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DESP17661 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DESP17661 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DESP17661 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DESP17661 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DESP17661 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DESP17661 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DESP17661 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DESP17661 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DESP17661 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DESP17661 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DESP17661 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DESP17661 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DESP17661 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DESP17661 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DESP17661 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DESP17661 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DESP17661 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DESP17661 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DESP17661 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DESP17661 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DESP17661 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DESP17661 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DESP17661 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DESP17661 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DESP17661 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DESP17661 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DESP17661 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DESP17661 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DESP17661 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DESP17661 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DESP17661 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DESP17661 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DESP17661 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DESP17661 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DESP17661 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DESP17661 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DESP17661 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms