Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSPP15924 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSPP15924 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSPP15924 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSPP15924 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSPP15924 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSPP15924 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DSPP15924 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSPP15924 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSPP15924 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSPP15924 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSPP15924 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSPP15924 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSPP15924 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSPP15924 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSPP15924 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DSPP15924 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DSPP15924 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSPP15924 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSPP15924 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSPP15924 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSPP15924 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSPP15924 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSPP15924 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSPP15924 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSPP15924 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSPP15924 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSPP15924 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSPP15924 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSPP15924 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSPP15924 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSPP15924 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSPP15924 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSPP15924 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSPP15924 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSPP15924 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSPP15924 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSPP15924 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSPP15924 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DSPP15924 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSPP15924 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSPP15924 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DSPP15924 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSPP15924 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSPP15924 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSPP15924 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DSPP15924 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSPP15924 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSPP15924 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSPP15924 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSPP15924 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSPP15924 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSPP15924 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSPP15924 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSPP15924 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DSPP15924 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSPP15924 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DSPP15924 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DSPP15924 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DSPP15924 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DSPP15924 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DSPP15924 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSPP15924 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSPP15924 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSPP15924 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DSPP15924 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSPP15924 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSPP15924 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSPP15924 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSPP15924 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSPP15924 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSPP15924 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSPP15924 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSPP15924 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSPP15924 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSPP15924 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSPP15924 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSPP15924 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSPP15924 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSPP15924 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSPP15924 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSPP15924 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSPP15924 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSPP15924 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSPP15924 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSPP15924 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DSPP15924 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSPP15924 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSPP15924 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSPP15924 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSPP15924 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSPP15924 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSPP15924 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSPP15924 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DSPP15924 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSPP15924 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSPP15924 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSPP15924 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSPP15924 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSPP15924 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms