Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms