Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRA1P14867 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms