Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms