Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms