Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00032P0C843 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00032P0C843 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00032P0C843 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00032P0C843 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00032P0C843 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00032P0C843 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00032P0C843 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00032P0C843 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00032P0C843 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00032P0C843 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00032P0C843 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00032P0C843 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00032P0C843 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00032P0C843 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00032P0C843 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00032P0C843 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00032P0C843 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00032P0C843 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00032P0C843 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00032P0C843 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00032P0C843 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00032P0C843 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00032P0C843 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00032P0C843 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00032P0C843 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00032P0C843 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00032P0C843 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00032P0C843 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00032P0C843 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00032P0C843 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00032P0C843 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00032P0C843 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00032P0C843 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00032P0C843 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00032P0C843 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00032P0C843 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00032P0C843 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00032P0C843 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00032P0C843 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00032P0C843 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00032P0C843 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00032P0C843 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00032P0C843 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00032P0C843 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00032P0C843 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00032P0C843 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00032P0C843 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00032P0C843 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00032P0C843 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00032P0C843 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms