Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HSP90AB1P08238 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HSP90AB1P08238 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HSP90AB1P08238 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HSP90AB1P08238 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HSP90AB1P08238 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HSP90AB1P08238 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HSP90AB1P08238 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HSP90AB1P08238 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HSP90AB1P08238 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HSP90AB1P08238 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HSP90AB1P08238 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HSP90AB1P08238 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HSP90AB1P08238 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HSP90AB1P08238 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HSP90AB1P08238 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HSP90AB1P08238 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HSP90AB1P08238 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HSP90AB1P08238 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HSP90AB1P08238 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HSP90AB1P08238 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HSP90AB1P08238 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HSP90AB1P08238 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HSP90AB1P08238 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HSP90AB1P08238 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HSP90AB1P08238 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HSP90AB1P08238 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HSP90AB1P08238 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HSP90AB1P08238 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HSP90AB1P08238 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HSP90AB1P08238 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HSP90AB1P08238 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HSP90AB1P08238 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HSP90AB1P08238 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HSP90AB1P08238 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HSP90AB1P08238 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HSP90AB1P08238 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HSP90AB1P08238 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HSP90AB1P08238 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms