Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms