Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN9O95484 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN9O95484 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN9O95484 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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CLDN9O95484 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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CLDN9O95484 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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CLDN9O95484 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN9O95484 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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CLDN9O95484 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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CLDN9O95484 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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CLDN9O95484 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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CLDN9O95484 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN9O95484 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN9O95484 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN9O95484 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN9O95484 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN9O95484 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN9O95484 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN9O95484 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN9O95484 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN9O95484 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN9O95484 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN9O95484 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN9O95484 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN9O95484 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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