Protein–RNA interactions for Protein: O95425

SVIL, Supervillin, humanhuman

Predictions only

Length 2,214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVILO95425 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SVILO95425 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SVILO95425 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SVILO95425 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
SVILO95425 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SVILO95425 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVILO95425 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVILO95425 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVILO95425 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVILO95425 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVILO95425 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVILO95425 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVILO95425 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SVILO95425 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVILO95425 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVILO95425 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVILO95425 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVILO95425 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVILO95425 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVILO95425 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVILO95425 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVILO95425 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVILO95425 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVILO95425 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVILO95425 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVILO95425 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVILO95425 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVILO95425 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SVILO95425 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SVILO95425 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SVILO95425 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVILO95425 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVILO95425 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVILO95425 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVILO95425 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVILO95425 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVILO95425 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVILO95425 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVILO95425 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVILO95425 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVILO95425 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVILO95425 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVILO95425 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVILO95425 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVILO95425 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVILO95425 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVILO95425 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVILO95425 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVILO95425 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVILO95425 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVILO95425 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVILO95425 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVILO95425 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVILO95425 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVILO95425 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVILO95425 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVILO95425 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVILO95425 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVILO95425 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVILO95425 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVILO95425 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVILO95425 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVILO95425 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVILO95425 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SVILO95425 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVILO95425 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVILO95425 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVILO95425 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVILO95425 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVILO95425 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVILO95425 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVILO95425 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVILO95425 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVILO95425 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVILO95425 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVILO95425 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVILO95425 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVILO95425 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVILO95425 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVILO95425 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVILO95425 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVILO95425 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVILO95425 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVILO95425 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SVILO95425 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVILO95425 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVILO95425 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVILO95425 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVILO95425 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVILO95425 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVILO95425 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVILO95425 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVILO95425 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVILO95425 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVILO95425 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVILO95425 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVILO95425 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVILO95425 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVILO95425 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVILO95425 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms