Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F6O75461 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F6O75461 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F6O75461 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F6O75461 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F6O75461 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F6O75461 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F6O75461 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F6O75461 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F6O75461 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F6O75461 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F6O75461 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F6O75461 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F6O75461 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
E2F6O75461 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
E2F6O75461 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
E2F6O75461 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F6O75461 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F6O75461 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F6O75461 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F6O75461 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F6O75461 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F6O75461 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F6O75461 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F6O75461 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F6O75461 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F6O75461 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F6O75461 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F6O75461 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F6O75461 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F6O75461 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F6O75461 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F6O75461 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F6O75461 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F6O75461 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F6O75461 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F6O75461 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F6O75461 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F6O75461 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F6O75461 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F6O75461 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F6O75461 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F6O75461 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F6O75461 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F6O75461 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F6O75461 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F6O75461 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F6O75461 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F6O75461 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F6O75461 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F6O75461 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F6O75461 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F6O75461 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F6O75461 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F6O75461 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F6O75461 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F6O75461 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F6O75461 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F6O75461 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18■□□□□ 0.47
E2F6O75461 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F6O75461 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F6O75461 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F6O75461 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F6O75461 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F6O75461 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F6O75461 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F6O75461 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F6O75461 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F6O75461 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F6O75461 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F6O75461 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F6O75461 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F6O75461 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F6O75461 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F6O75461 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F6O75461 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F6O75461 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F6O75461 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F6O75461 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F6O75461 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F6O75461 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F6O75461 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F6O75461 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F6O75461 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F6O75461 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F6O75461 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F6O75461 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F6O75461 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F6O75461 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F6O75461 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F6O75461 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F6O75461 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F6O75461 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F6O75461 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F6O75461 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F6O75461 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F6O75461 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F6O75461 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F6O75461 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F6O75461 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms