Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAMP4O75379 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAMP4O75379 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAMP4O75379 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAMP4O75379 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAMP4O75379 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAMP4O75379 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAMP4O75379 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAMP4O75379 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAMP4O75379 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAMP4O75379 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAMP4O75379 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAMP4O75379 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAMP4O75379 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
VAMP4O75379 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAMP4O75379 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAMP4O75379 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VAMP4O75379 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
VAMP4O75379 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAMP4O75379 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms