Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA4O75335 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms