Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms