Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms