Protein–RNA interactions for Protein: O15541

RNF113A, RING finger protein 113A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF113AO15541 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF113AO15541 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF113AO15541 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF113AO15541 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF113AO15541 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF113AO15541 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF113AO15541 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF113AO15541 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF113AO15541 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF113AO15541 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF113AO15541 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF113AO15541 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF113AO15541 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF113AO15541 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF113AO15541 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF113AO15541 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF113AO15541 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF113AO15541 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.9 ms