Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC5O15511 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC5O15511 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC5O15511 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC5O15511 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC5O15511 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC5O15511 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC5O15511 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC5O15511 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC5O15511 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC5O15511 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC5O15511 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC5O15511 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC5O15511 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC5O15511 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC5O15511 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC5O15511 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC5O15511 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC5O15511 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC5O15511 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC5O15511 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC5O15511 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC5O15511 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC5O15511 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms