Protein–RNA interactions for Protein: O15066

KIF3B, Kinesin-like protein KIF3B, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3BO15066 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KIF3BO15066 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KIF3BO15066 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KIF3BO15066 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KIF3BO15066 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KIF3BO15066 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KIF3BO15066 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KIF3BO15066 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KIF3BO15066 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KIF3BO15066 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KIF3BO15066 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF3BO15066 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms