Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3EO15041 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3EO15041 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms