Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CASKO14936 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASKO14936 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASKO14936 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASKO14936 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASKO14936 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CASKO14936 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CASKO14936 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CASKO14936 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASKO14936 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASKO14936 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASKO14936 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CASKO14936 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CASKO14936 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASKO14936 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASKO14936 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASKO14936 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASKO14936 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASKO14936 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASKO14936 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASKO14936 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASKO14936 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASKO14936 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASKO14936 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASKO14936 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASKO14936 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASKO14936 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASKO14936 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASKO14936 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASKO14936 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASKO14936 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASKO14936 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASKO14936 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASKO14936 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASKO14936 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASKO14936 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CASKO14936 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASKO14936 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASKO14936 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASKO14936 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASKO14936 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASKO14936 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASKO14936 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASKO14936 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASKO14936 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASKO14936 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASKO14936 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASKO14936 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASKO14936 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASKO14936 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASKO14936 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASKO14936 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASKO14936 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASKO14936 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASKO14936 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASKO14936 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASKO14936 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASKO14936 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASKO14936 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASKO14936 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASKO14936 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASKO14936 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASKO14936 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASKO14936 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASKO14936 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASKO14936 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASKO14936 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASKO14936 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASKO14936 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASKO14936 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASKO14936 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASKO14936 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASKO14936 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASKO14936 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASKO14936 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASKO14936 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASKO14936 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CASKO14936 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASKO14936 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASKO14936 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASKO14936 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASKO14936 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASKO14936 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASKO14936 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASKO14936 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASKO14936 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASKO14936 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASKO14936 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASKO14936 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASKO14936 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASKO14936 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASKO14936 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CASKO14936 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASKO14936 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASKO14936 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASKO14936 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASKO14936 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASKO14936 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASKO14936 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASKO14936 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms