Protein–RNA interactions for Protein: O14896

IRF6, Interferon regulatory factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF6O14896 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF6O14896 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF6O14896 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF6O14896 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF6O14896 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IRF6O14896 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IRF6O14896 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IRF6O14896 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IRF6O14896 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IRF6O14896 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IRF6O14896 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IRF6O14896 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IRF6O14896 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IRF6O14896 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF6O14896 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF6O14896 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF6O14896 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF6O14896 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF6O14896 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF6O14896 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF6O14896 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF6O14896 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF6O14896 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF6O14896 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF6O14896 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF6O14896 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF6O14896 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF6O14896 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF6O14896 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF6O14896 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF6O14896 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF6O14896 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF6O14896 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF6O14896 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF6O14896 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF6O14896 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF6O14896 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF6O14896 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF6O14896 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF6O14896 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF6O14896 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF6O14896 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF6O14896 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF6O14896 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF6O14896 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF6O14896 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF6O14896 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF6O14896 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF6O14896 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF6O14896 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF6O14896 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF6O14896 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF6O14896 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF6O14896 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF6O14896 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF6O14896 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF6O14896 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF6O14896 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF6O14896 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF6O14896 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF6O14896 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF6O14896 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF6O14896 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF6O14896 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF6O14896 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF6O14896 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF6O14896 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF6O14896 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF6O14896 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF6O14896 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF6O14896 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF6O14896 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF6O14896 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF6O14896 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF6O14896 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF6O14896 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF6O14896 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF6O14896 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF6O14896 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF6O14896 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF6O14896 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF6O14896 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF6O14896 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF6O14896 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF6O14896 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF6O14896 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF6O14896 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF6O14896 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF6O14896 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF6O14896 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF6O14896 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF6O14896 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF6O14896 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF6O14896 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF6O14896 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF6O14896 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF6O14896 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF6O14896 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF6O14896 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF6O14896 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms