Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms