Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms