Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23■■□□□ 1.27
H7C1D1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
H7C1D1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
H7C1D1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H7C1D1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H7C1D1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H7C1D1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H7C1D1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H7C1D1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
H7C1D1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H7C1D1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H7C1D1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H7C1D1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H7C1D1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H7C1D1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H7C1D1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H7C1D1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H7C1D1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H7C1D1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H7C1D1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
H7C1D1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H7C1D1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H7C1D1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
H7C1D1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H7C1D1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H7C1D1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
H7C1D1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H7C1D1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H7C1D1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
H7C1D1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H7C1D1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
H7C1D1 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
H7C1D1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
H7C1D1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H7C1D1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
H7C1D1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
H7C1D1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
H7C1D1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
H7C1D1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
H7C1D1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
H7C1D1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
H7C1D1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H7C1D1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
H7C1D1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
H7C1D1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H7C1D1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H7C1D1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H7C1D1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H7C1D1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H7C1D1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
H7C1D1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
H7C1D1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H7C1D1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H7C1D1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
H7C1D1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H7C1D1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H7C1D1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H7C1D1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H7C1D1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H7C1D1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H7C1D1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
H7C1D1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H7C1D1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
H7C1D1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H7C1D1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H7C1D1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H7C1D1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H7C1D1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H7C1D1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H7C1D1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H7C1D1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H7C1D1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H7C1D1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H7C1D1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H7C1D1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H7C1D1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H7C1D1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H7C1D1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H7C1D1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H7C1D1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H7C1D1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H7C1D1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H7C1D1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H7C1D1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H7C1D1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H7C1D1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
H7C1D1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H7C1D1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
H7C1D1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H7C1D1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H7C1D1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H7C1D1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H7C1D1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H7C1D1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
H7C1D1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H7C1D1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H7C1D1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
H7C1D1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H7C1D1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H7C1D1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms