Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms