Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms