Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms