Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM200CA6NKL6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM200CA6NKL6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM200CA6NKL6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM200CA6NKL6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM200CA6NKL6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM200CA6NKL6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM200CA6NKL6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM200CA6NKL6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM200CA6NKL6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM200CA6NKL6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM200CA6NKL6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM200CA6NKL6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM200CA6NKL6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM200CA6NKL6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM200CA6NKL6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM200CA6NKL6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM200CA6NKL6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM200CA6NKL6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM200CA6NKL6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM200CA6NKL6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM200CA6NKL6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM200CA6NKL6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM200CA6NKL6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM200CA6NKL6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM200CA6NKL6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM200CA6NKL6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM200CA6NKL6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM200CA6NKL6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM200CA6NKL6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM200CA6NKL6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM200CA6NKL6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM200CA6NKL6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM200CA6NKL6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM200CA6NKL6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM200CA6NKL6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM200CA6NKL6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms