Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC85CA6NKD9 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC85CA6NKD9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC85CA6NKD9 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC85CA6NKD9 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC85CA6NKD9 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC85CA6NKD9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC85CA6NKD9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC85CA6NKD9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC85CA6NKD9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC85CA6NKD9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC85CA6NKD9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC85CA6NKD9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC85CA6NKD9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC85CA6NKD9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC85CA6NKD9 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC85CA6NKD9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC85CA6NKD9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC85CA6NKD9 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC85CA6NKD9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC85CA6NKD9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC85CA6NKD9 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC85CA6NKD9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC85CA6NKD9 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC85CA6NKD9 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC85CA6NKD9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC85CA6NKD9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC85CA6NKD9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC85CA6NKD9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC85CA6NKD9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC85CA6NKD9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC85CA6NKD9 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC85CA6NKD9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC85CA6NKD9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC85CA6NKD9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC85CA6NKD9 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC85CA6NKD9 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC85CA6NKD9 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC85CA6NKD9 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC85CA6NKD9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC85CA6NKD9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC85CA6NKD9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC85CA6NKD9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC85CA6NKD9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCDC85CA6NKD9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC85CA6NKD9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms