Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LIPT2A6NK58 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LIPT2A6NK58 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LIPT2A6NK58 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LIPT2A6NK58 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LIPT2A6NK58 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LIPT2A6NK58 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LIPT2A6NK58 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LIPT2A6NK58 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LIPT2A6NK58 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms