Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms