Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms