Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms