Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBA6A0AVT1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBA6A0AVT1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBA6A0AVT1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBA6A0AVT1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBA6A0AVT1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBA6A0AVT1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBA6A0AVT1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBA6A0AVT1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBA6A0AVT1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBA6A0AVT1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBA6A0AVT1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBA6A0AVT1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBA6A0AVT1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBA6A0AVT1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBA6A0AVT1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBA6A0AVT1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBA6A0AVT1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBA6A0AVT1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBA6A0AVT1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBA6A0AVT1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBA6A0AVT1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBA6A0AVT1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBA6A0AVT1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBA6A0AVT1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBA6A0AVT1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBA6A0AVT1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBA6A0AVT1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBA6A0AVT1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms