Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SFI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SFI3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0D9SFI3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0D9SFI3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0D9SFI3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0D9SFI3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0D9SFI3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0D9SFI3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0D9SFI3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0D9SFI3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0D9SFI3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0D9SFI3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
A0A0D9SFI3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0D9SFI3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms