Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUBP2Q9Y5Y2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUBP2Q9Y5Y2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUBP2Q9Y5Y2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUBP2Q9Y5Y2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUBP2Q9Y5Y2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUBP2Q9Y5Y2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NUBP2Q9Y5Y2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NUBP2Q9Y5Y2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NUBP2Q9Y5Y2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUBP2Q9Y5Y2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUBP2Q9Y5Y2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUBP2Q9Y5Y2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUBP2Q9Y5Y2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUBP2Q9Y5Y2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUBP2Q9Y5Y2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUBP2Q9Y5Y2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUBP2Q9Y5Y2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUBP2Q9Y5Y2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUBP2Q9Y5Y2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUBP2Q9Y5Y2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUBP2Q9Y5Y2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUBP2Q9Y5Y2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NUBP2Q9Y5Y2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUBP2Q9Y5Y2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUBP2Q9Y5Y2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUBP2Q9Y5Y2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUBP2Q9Y5Y2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUBP2Q9Y5Y2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUBP2Q9Y5Y2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUBP2Q9Y5Y2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUBP2Q9Y5Y2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUBP2Q9Y5Y2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUBP2Q9Y5Y2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUBP2Q9Y5Y2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUBP2Q9Y5Y2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUBP2Q9Y5Y2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUBP2Q9Y5Y2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUBP2Q9Y5Y2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUBP2Q9Y5Y2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUBP2Q9Y5Y2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUBP2Q9Y5Y2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUBP2Q9Y5Y2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUBP2Q9Y5Y2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUBP2Q9Y5Y2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUBP2Q9Y5Y2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUBP2Q9Y5Y2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUBP2Q9Y5Y2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUBP2Q9Y5Y2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUBP2Q9Y5Y2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUBP2Q9Y5Y2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUBP2Q9Y5Y2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUBP2Q9Y5Y2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUBP2Q9Y5Y2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NUBP2Q9Y5Y2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUBP2Q9Y5Y2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUBP2Q9Y5Y2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUBP2Q9Y5Y2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUBP2Q9Y5Y2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NUBP2Q9Y5Y2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUBP2Q9Y5Y2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUBP2Q9Y5Y2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUBP2Q9Y5Y2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUBP2Q9Y5Y2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUBP2Q9Y5Y2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUBP2Q9Y5Y2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUBP2Q9Y5Y2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUBP2Q9Y5Y2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NUBP2Q9Y5Y2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUBP2Q9Y5Y2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUBP2Q9Y5Y2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUBP2Q9Y5Y2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUBP2Q9Y5Y2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUBP2Q9Y5Y2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUBP2Q9Y5Y2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUBP2Q9Y5Y2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUBP2Q9Y5Y2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUBP2Q9Y5Y2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUBP2Q9Y5Y2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NUBP2Q9Y5Y2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUBP2Q9Y5Y2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUBP2Q9Y5Y2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUBP2Q9Y5Y2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUBP2Q9Y5Y2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUBP2Q9Y5Y2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUBP2Q9Y5Y2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUBP2Q9Y5Y2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUBP2Q9Y5Y2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUBP2Q9Y5Y2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUBP2Q9Y5Y2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUBP2Q9Y5Y2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUBP2Q9Y5Y2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUBP2Q9Y5Y2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUBP2Q9Y5Y2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUBP2Q9Y5Y2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUBP2Q9Y5Y2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUBP2Q9Y5Y2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms