Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4Z2

NEUROG3, Neurogenin-3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROG3Q9Y4Z2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEUROG3Q9Y4Z2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEUROG3Q9Y4Z2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEUROG3Q9Y4Z2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEUROG3Q9Y4Z2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEUROG3Q9Y4Z2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEUROG3Q9Y4Z2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEUROG3Q9Y4Z2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEUROG3Q9Y4Z2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEUROG3Q9Y4Z2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEUROG3Q9Y4Z2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEUROG3Q9Y4Z2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEUROG3Q9Y4Z2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEUROG3Q9Y4Z2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEUROG3Q9Y4Z2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEUROG3Q9Y4Z2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEUROG3Q9Y4Z2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEUROG3Q9Y4Z2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEUROG3Q9Y4Z2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEUROG3Q9Y4Z2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEUROG3Q9Y4Z2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEUROG3Q9Y4Z2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEUROG3Q9Y4Z2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEUROG3Q9Y4Z2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEUROG3Q9Y4Z2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEUROG3Q9Y4Z2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEUROG3Q9Y4Z2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEUROG3Q9Y4Z2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEUROG3Q9Y4Z2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEUROG3Q9Y4Z2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEUROG3Q9Y4Z2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEUROG3Q9Y4Z2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEUROG3Q9Y4Z2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEUROG3Q9Y4Z2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEUROG3Q9Y4Z2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEUROG3Q9Y4Z2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEUROG3Q9Y4Z2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEUROG3Q9Y4Z2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEUROG3Q9Y4Z2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEUROG3Q9Y4Z2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEUROG3Q9Y4Z2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEUROG3Q9Y4Z2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEUROG3Q9Y4Z2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEUROG3Q9Y4Z2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEUROG3Q9Y4Z2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEUROG3Q9Y4Z2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEUROG3Q9Y4Z2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEUROG3Q9Y4Z2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEUROG3Q9Y4Z2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEUROG3Q9Y4Z2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEUROG3Q9Y4Z2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEUROG3Q9Y4Z2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEUROG3Q9Y4Z2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEUROG3Q9Y4Z2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEUROG3Q9Y4Z2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEUROG3Q9Y4Z2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEUROG3Q9Y4Z2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEUROG3Q9Y4Z2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEUROG3Q9Y4Z2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEUROG3Q9Y4Z2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEUROG3Q9Y4Z2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NEUROG3Q9Y4Z2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEUROG3Q9Y4Z2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEUROG3Q9Y4Z2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEUROG3Q9Y4Z2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEUROG3Q9Y4Z2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEUROG3Q9Y4Z2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEUROG3Q9Y4Z2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEUROG3Q9Y4Z2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NEUROG3Q9Y4Z2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEUROG3Q9Y4Z2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEUROG3Q9Y4Z2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEUROG3Q9Y4Z2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEUROG3Q9Y4Z2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEUROG3Q9Y4Z2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NEUROG3Q9Y4Z2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEUROG3Q9Y4Z2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NEUROG3Q9Y4Z2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEUROG3Q9Y4Z2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEUROG3Q9Y4Z2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEUROG3Q9Y4Z2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEUROG3Q9Y4Z2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEUROG3Q9Y4Z2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEUROG3Q9Y4Z2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEUROG3Q9Y4Z2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROG3Q9Y4Z2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEUROG3Q9Y4Z2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEUROG3Q9Y4Z2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEUROG3Q9Y4Z2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROG3Q9Y4Z2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROG3Q9Y4Z2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROG3Q9Y4Z2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROG3Q9Y4Z2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROG3Q9Y4Z2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROG3Q9Y4Z2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROG3Q9Y4Z2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROG3Q9Y4Z2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROG3Q9Y4Z2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEUROG3Q9Y4Z2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEUROG3Q9Y4Z2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 230.8 ms