Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPRKBQ9Y3C4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPRKBQ9Y3C4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TPRKBQ9Y3C4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPRKBQ9Y3C4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPRKBQ9Y3C4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPRKBQ9Y3C4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TPRKBQ9Y3C4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPRKBQ9Y3C4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPRKBQ9Y3C4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPRKBQ9Y3C4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPRKBQ9Y3C4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPRKBQ9Y3C4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPRKBQ9Y3C4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPRKBQ9Y3C4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPRKBQ9Y3C4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TPRKBQ9Y3C4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TPRKBQ9Y3C4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPRKBQ9Y3C4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPRKBQ9Y3C4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TPRKBQ9Y3C4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPRKBQ9Y3C4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPRKBQ9Y3C4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPRKBQ9Y3C4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPRKBQ9Y3C4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPRKBQ9Y3C4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPRKBQ9Y3C4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPRKBQ9Y3C4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPRKBQ9Y3C4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPRKBQ9Y3C4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPRKBQ9Y3C4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPRKBQ9Y3C4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPRKBQ9Y3C4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPRKBQ9Y3C4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPRKBQ9Y3C4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPRKBQ9Y3C4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPRKBQ9Y3C4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPRKBQ9Y3C4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPRKBQ9Y3C4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPRKBQ9Y3C4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPRKBQ9Y3C4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPRKBQ9Y3C4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPRKBQ9Y3C4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPRKBQ9Y3C4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPRKBQ9Y3C4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPRKBQ9Y3C4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPRKBQ9Y3C4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPRKBQ9Y3C4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPRKBQ9Y3C4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPRKBQ9Y3C4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPRKBQ9Y3C4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TPRKBQ9Y3C4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TPRKBQ9Y3C4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPRKBQ9Y3C4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPRKBQ9Y3C4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPRKBQ9Y3C4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPRKBQ9Y3C4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPRKBQ9Y3C4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPRKBQ9Y3C4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPRKBQ9Y3C4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPRKBQ9Y3C4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPRKBQ9Y3C4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPRKBQ9Y3C4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPRKBQ9Y3C4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TPRKBQ9Y3C4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPRKBQ9Y3C4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPRKBQ9Y3C4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPRKBQ9Y3C4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPRKBQ9Y3C4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPRKBQ9Y3C4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPRKBQ9Y3C4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPRKBQ9Y3C4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPRKBQ9Y3C4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPRKBQ9Y3C4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPRKBQ9Y3C4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPRKBQ9Y3C4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPRKBQ9Y3C4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPRKBQ9Y3C4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPRKBQ9Y3C4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPRKBQ9Y3C4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPRKBQ9Y3C4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TPRKBQ9Y3C4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPRKBQ9Y3C4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TPRKBQ9Y3C4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPRKBQ9Y3C4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPRKBQ9Y3C4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPRKBQ9Y3C4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPRKBQ9Y3C4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TPRKBQ9Y3C4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPRKBQ9Y3C4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPRKBQ9Y3C4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TPRKBQ9Y3C4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPRKBQ9Y3C4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPRKBQ9Y3C4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPRKBQ9Y3C4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPRKBQ9Y3C4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPRKBQ9Y3C4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPRKBQ9Y3C4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TPRKBQ9Y3C4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPRKBQ9Y3C4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms