Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B4

SF3B6, Splicing factor 3B subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B6Q9Y3B4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SF3B6Q9Y3B4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SF3B6Q9Y3B4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SF3B6Q9Y3B4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SF3B6Q9Y3B4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SF3B6Q9Y3B4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SF3B6Q9Y3B4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SF3B6Q9Y3B4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SF3B6Q9Y3B4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SF3B6Q9Y3B4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SF3B6Q9Y3B4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SF3B6Q9Y3B4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SF3B6Q9Y3B4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SF3B6Q9Y3B4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SF3B6Q9Y3B4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SF3B6Q9Y3B4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SF3B6Q9Y3B4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SF3B6Q9Y3B4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SF3B6Q9Y3B4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SF3B6Q9Y3B4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SF3B6Q9Y3B4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SF3B6Q9Y3B4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SF3B6Q9Y3B4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SF3B6Q9Y3B4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SF3B6Q9Y3B4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SF3B6Q9Y3B4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SF3B6Q9Y3B4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SF3B6Q9Y3B4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SF3B6Q9Y3B4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SF3B6Q9Y3B4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SF3B6Q9Y3B4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SF3B6Q9Y3B4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SF3B6Q9Y3B4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SF3B6Q9Y3B4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SF3B6Q9Y3B4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SF3B6Q9Y3B4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SF3B6Q9Y3B4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SF3B6Q9Y3B4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SF3B6Q9Y3B4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SF3B6Q9Y3B4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SF3B6Q9Y3B4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SF3B6Q9Y3B4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SF3B6Q9Y3B4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SF3B6Q9Y3B4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SF3B6Q9Y3B4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SF3B6Q9Y3B4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SF3B6Q9Y3B4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SF3B6Q9Y3B4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SF3B6Q9Y3B4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SF3B6Q9Y3B4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SF3B6Q9Y3B4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SF3B6Q9Y3B4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SF3B6Q9Y3B4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SF3B6Q9Y3B4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SF3B6Q9Y3B4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SF3B6Q9Y3B4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SF3B6Q9Y3B4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SF3B6Q9Y3B4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SF3B6Q9Y3B4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SF3B6Q9Y3B4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SF3B6Q9Y3B4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SF3B6Q9Y3B4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SF3B6Q9Y3B4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SF3B6Q9Y3B4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SF3B6Q9Y3B4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SF3B6Q9Y3B4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SF3B6Q9Y3B4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SF3B6Q9Y3B4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SF3B6Q9Y3B4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SF3B6Q9Y3B4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SF3B6Q9Y3B4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SF3B6Q9Y3B4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SF3B6Q9Y3B4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SF3B6Q9Y3B4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SF3B6Q9Y3B4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SF3B6Q9Y3B4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SF3B6Q9Y3B4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SF3B6Q9Y3B4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SF3B6Q9Y3B4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SF3B6Q9Y3B4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SF3B6Q9Y3B4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SF3B6Q9Y3B4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SF3B6Q9Y3B4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SF3B6Q9Y3B4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SF3B6Q9Y3B4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SF3B6Q9Y3B4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SF3B6Q9Y3B4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SF3B6Q9Y3B4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SF3B6Q9Y3B4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SF3B6Q9Y3B4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SF3B6Q9Y3B4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SF3B6Q9Y3B4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SF3B6Q9Y3B4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SF3B6Q9Y3B4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SF3B6Q9Y3B4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SF3B6Q9Y3B4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SF3B6Q9Y3B4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SF3B6Q9Y3B4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SF3B6Q9Y3B4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SF3B6Q9Y3B4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms