Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2P0

ZNF835, Zinc finger protein 835, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF835Q9Y2P0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF835Q9Y2P0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF835Q9Y2P0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF835Q9Y2P0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF835Q9Y2P0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF835Q9Y2P0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF835Q9Y2P0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF835Q9Y2P0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF835Q9Y2P0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF835Q9Y2P0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF835Q9Y2P0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF835Q9Y2P0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF835Q9Y2P0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF835Q9Y2P0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF835Q9Y2P0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF835Q9Y2P0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF835Q9Y2P0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF835Q9Y2P0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF835Q9Y2P0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF835Q9Y2P0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF835Q9Y2P0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF835Q9Y2P0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF835Q9Y2P0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF835Q9Y2P0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF835Q9Y2P0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF835Q9Y2P0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF835Q9Y2P0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF835Q9Y2P0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF835Q9Y2P0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF835Q9Y2P0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF835Q9Y2P0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF835Q9Y2P0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF835Q9Y2P0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF835Q9Y2P0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF835Q9Y2P0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF835Q9Y2P0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF835Q9Y2P0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF835Q9Y2P0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF835Q9Y2P0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF835Q9Y2P0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF835Q9Y2P0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF835Q9Y2P0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF835Q9Y2P0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF835Q9Y2P0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF835Q9Y2P0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF835Q9Y2P0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF835Q9Y2P0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF835Q9Y2P0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF835Q9Y2P0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF835Q9Y2P0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF835Q9Y2P0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF835Q9Y2P0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF835Q9Y2P0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF835Q9Y2P0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF835Q9Y2P0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF835Q9Y2P0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF835Q9Y2P0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF835Q9Y2P0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF835Q9Y2P0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF835Q9Y2P0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF835Q9Y2P0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF835Q9Y2P0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF835Q9Y2P0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF835Q9Y2P0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF835Q9Y2P0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF835Q9Y2P0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF835Q9Y2P0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF835Q9Y2P0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF835Q9Y2P0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF835Q9Y2P0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF835Q9Y2P0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF835Q9Y2P0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF835Q9Y2P0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF835Q9Y2P0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF835Q9Y2P0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF835Q9Y2P0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF835Q9Y2P0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF835Q9Y2P0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF835Q9Y2P0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF835Q9Y2P0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF835Q9Y2P0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF835Q9Y2P0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF835Q9Y2P0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF835Q9Y2P0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF835Q9Y2P0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF835Q9Y2P0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF835Q9Y2P0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF835Q9Y2P0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF835Q9Y2P0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF835Q9Y2P0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF835Q9Y2P0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF835Q9Y2P0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF835Q9Y2P0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF835Q9Y2P0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF835Q9Y2P0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF835Q9Y2P0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF835Q9Y2P0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF835Q9Y2P0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF835Q9Y2P0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF835Q9Y2P0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms