Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNL2

SSR3, Translocon-associated protein subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR3Q9UNL2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSR3Q9UNL2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSR3Q9UNL2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSR3Q9UNL2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSR3Q9UNL2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSR3Q9UNL2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSR3Q9UNL2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSR3Q9UNL2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSR3Q9UNL2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSR3Q9UNL2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSR3Q9UNL2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSR3Q9UNL2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSR3Q9UNL2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSR3Q9UNL2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSR3Q9UNL2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSR3Q9UNL2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSR3Q9UNL2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSR3Q9UNL2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSR3Q9UNL2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSR3Q9UNL2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSR3Q9UNL2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSR3Q9UNL2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSR3Q9UNL2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSR3Q9UNL2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSR3Q9UNL2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSR3Q9UNL2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SSR3Q9UNL2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSR3Q9UNL2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSR3Q9UNL2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSR3Q9UNL2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SSR3Q9UNL2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSR3Q9UNL2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSR3Q9UNL2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSR3Q9UNL2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSR3Q9UNL2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSR3Q9UNL2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSR3Q9UNL2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSR3Q9UNL2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSR3Q9UNL2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSR3Q9UNL2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSR3Q9UNL2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSR3Q9UNL2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSR3Q9UNL2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSR3Q9UNL2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSR3Q9UNL2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSR3Q9UNL2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSR3Q9UNL2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSR3Q9UNL2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSR3Q9UNL2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSR3Q9UNL2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSR3Q9UNL2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSR3Q9UNL2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSR3Q9UNL2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSR3Q9UNL2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSR3Q9UNL2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSR3Q9UNL2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSR3Q9UNL2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSR3Q9UNL2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSR3Q9UNL2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSR3Q9UNL2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSR3Q9UNL2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSR3Q9UNL2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSR3Q9UNL2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSR3Q9UNL2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSR3Q9UNL2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SSR3Q9UNL2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSR3Q9UNL2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSR3Q9UNL2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSR3Q9UNL2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSR3Q9UNL2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSR3Q9UNL2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SSR3Q9UNL2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSR3Q9UNL2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSR3Q9UNL2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSR3Q9UNL2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSR3Q9UNL2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSR3Q9UNL2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSR3Q9UNL2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSR3Q9UNL2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSR3Q9UNL2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSR3Q9UNL2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SSR3Q9UNL2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSR3Q9UNL2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSR3Q9UNL2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSR3Q9UNL2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSR3Q9UNL2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSR3Q9UNL2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSR3Q9UNL2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSR3Q9UNL2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSR3Q9UNL2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSR3Q9UNL2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSR3Q9UNL2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSR3Q9UNL2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSR3Q9UNL2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSR3Q9UNL2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSR3Q9UNL2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SSR3Q9UNL2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSR3Q9UNL2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SSR3Q9UNL2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SSR3Q9UNL2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms