Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGI6

KCNN3, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN3Q9UGI6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNN3Q9UGI6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNN3Q9UGI6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNN3Q9UGI6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNN3Q9UGI6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNN3Q9UGI6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNN3Q9UGI6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNN3Q9UGI6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNN3Q9UGI6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCNN3Q9UGI6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCNN3Q9UGI6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNN3Q9UGI6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNN3Q9UGI6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNN3Q9UGI6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNN3Q9UGI6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNN3Q9UGI6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNN3Q9UGI6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNN3Q9UGI6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNN3Q9UGI6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNN3Q9UGI6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNN3Q9UGI6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNN3Q9UGI6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNN3Q9UGI6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNN3Q9UGI6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNN3Q9UGI6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNN3Q9UGI6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNN3Q9UGI6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNN3Q9UGI6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNN3Q9UGI6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNN3Q9UGI6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNN3Q9UGI6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNN3Q9UGI6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNN3Q9UGI6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNN3Q9UGI6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNN3Q9UGI6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNN3Q9UGI6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNN3Q9UGI6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNN3Q9UGI6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNN3Q9UGI6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNN3Q9UGI6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNN3Q9UGI6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNN3Q9UGI6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNN3Q9UGI6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNN3Q9UGI6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNN3Q9UGI6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNN3Q9UGI6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
KCNN3Q9UGI6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNN3Q9UGI6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNN3Q9UGI6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNN3Q9UGI6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNN3Q9UGI6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNN3Q9UGI6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNN3Q9UGI6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNN3Q9UGI6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNN3Q9UGI6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNN3Q9UGI6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNN3Q9UGI6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNN3Q9UGI6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNN3Q9UGI6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNN3Q9UGI6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNN3Q9UGI6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNN3Q9UGI6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNN3Q9UGI6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNN3Q9UGI6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNN3Q9UGI6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNN3Q9UGI6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNN3Q9UGI6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNN3Q9UGI6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNN3Q9UGI6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNN3Q9UGI6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNN3Q9UGI6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNN3Q9UGI6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNN3Q9UGI6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNN3Q9UGI6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNN3Q9UGI6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNN3Q9UGI6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNN3Q9UGI6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNN3Q9UGI6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNN3Q9UGI6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNN3Q9UGI6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNN3Q9UGI6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNN3Q9UGI6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNN3Q9UGI6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNN3Q9UGI6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNN3Q9UGI6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNN3Q9UGI6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNN3Q9UGI6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNN3Q9UGI6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNN3Q9UGI6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNN3Q9UGI6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNN3Q9UGI6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNN3Q9UGI6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNN3Q9UGI6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNN3Q9UGI6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNN3Q9UGI6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNN3Q9UGI6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNN3Q9UGI6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNN3Q9UGI6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNN3Q9UGI6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNN3Q9UGI6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms