Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPARGC1AQ9UBK2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPARGC1AQ9UBK2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PPARGC1AQ9UBK2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPARGC1AQ9UBK2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPARGC1AQ9UBK2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPARGC1AQ9UBK2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPARGC1AQ9UBK2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPARGC1AQ9UBK2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPARGC1AQ9UBK2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPARGC1AQ9UBK2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPARGC1AQ9UBK2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PPARGC1AQ9UBK2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPARGC1AQ9UBK2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPARGC1AQ9UBK2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPARGC1AQ9UBK2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPARGC1AQ9UBK2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPARGC1AQ9UBK2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPARGC1AQ9UBK2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPARGC1AQ9UBK2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPARGC1AQ9UBK2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPARGC1AQ9UBK2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPARGC1AQ9UBK2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPARGC1AQ9UBK2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPARGC1AQ9UBK2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPARGC1AQ9UBK2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPARGC1AQ9UBK2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPARGC1AQ9UBK2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPARGC1AQ9UBK2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PPARGC1AQ9UBK2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PPARGC1AQ9UBK2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PPARGC1AQ9UBK2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPARGC1AQ9UBK2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPARGC1AQ9UBK2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPARGC1AQ9UBK2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPARGC1AQ9UBK2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPARGC1AQ9UBK2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPARGC1AQ9UBK2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPARGC1AQ9UBK2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPARGC1AQ9UBK2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPARGC1AQ9UBK2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPARGC1AQ9UBK2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PPARGC1AQ9UBK2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPARGC1AQ9UBK2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPARGC1AQ9UBK2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPARGC1AQ9UBK2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPARGC1AQ9UBK2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPARGC1AQ9UBK2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPARGC1AQ9UBK2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPARGC1AQ9UBK2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPARGC1AQ9UBK2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPARGC1AQ9UBK2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPARGC1AQ9UBK2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPARGC1AQ9UBK2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPARGC1AQ9UBK2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPARGC1AQ9UBK2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPARGC1AQ9UBK2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPARGC1AQ9UBK2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPARGC1AQ9UBK2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PPARGC1AQ9UBK2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PPARGC1AQ9UBK2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPARGC1AQ9UBK2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPARGC1AQ9UBK2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPARGC1AQ9UBK2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PPARGC1AQ9UBK2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPARGC1AQ9UBK2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPARGC1AQ9UBK2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPARGC1AQ9UBK2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPARGC1AQ9UBK2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPARGC1AQ9UBK2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PPARGC1AQ9UBK2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPARGC1AQ9UBK2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPARGC1AQ9UBK2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPARGC1AQ9UBK2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPARGC1AQ9UBK2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPARGC1AQ9UBK2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPARGC1AQ9UBK2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPARGC1AQ9UBK2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPARGC1AQ9UBK2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPARGC1AQ9UBK2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PPARGC1AQ9UBK2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPARGC1AQ9UBK2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPARGC1AQ9UBK2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPARGC1AQ9UBK2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPARGC1AQ9UBK2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPARGC1AQ9UBK2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPARGC1AQ9UBK2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPARGC1AQ9UBK2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPARGC1AQ9UBK2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PPARGC1AQ9UBK2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPARGC1AQ9UBK2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPARGC1AQ9UBK2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPARGC1AQ9UBK2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPARGC1AQ9UBK2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms