Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HCN3Q9P1Z3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HCN3Q9P1Z3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HCN3Q9P1Z3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HCN3Q9P1Z3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HCN3Q9P1Z3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HCN3Q9P1Z3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HCN3Q9P1Z3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HCN3Q9P1Z3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HCN3Q9P1Z3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HCN3Q9P1Z3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HCN3Q9P1Z3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HCN3Q9P1Z3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HCN3Q9P1Z3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HCN3Q9P1Z3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HCN3Q9P1Z3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HCN3Q9P1Z3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HCN3Q9P1Z3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HCN3Q9P1Z3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HCN3Q9P1Z3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HCN3Q9P1Z3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HCN3Q9P1Z3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HCN3Q9P1Z3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HCN3Q9P1Z3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HCN3Q9P1Z3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HCN3Q9P1Z3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HCN3Q9P1Z3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HCN3Q9P1Z3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HCN3Q9P1Z3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HCN3Q9P1Z3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HCN3Q9P1Z3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HCN3Q9P1Z3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HCN3Q9P1Z3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HCN3Q9P1Z3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HCN3Q9P1Z3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HCN3Q9P1Z3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HCN3Q9P1Z3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HCN3Q9P1Z3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HCN3Q9P1Z3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HCN3Q9P1Z3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HCN3Q9P1Z3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HCN3Q9P1Z3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HCN3Q9P1Z3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HCN3Q9P1Z3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HCN3Q9P1Z3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HCN3Q9P1Z3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HCN3Q9P1Z3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HCN3Q9P1Z3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HCN3Q9P1Z3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HCN3Q9P1Z3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HCN3Q9P1Z3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HCN3Q9P1Z3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HCN3Q9P1Z3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HCN3Q9P1Z3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HCN3Q9P1Z3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HCN3Q9P1Z3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HCN3Q9P1Z3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HCN3Q9P1Z3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HCN3Q9P1Z3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HCN3Q9P1Z3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HCN3Q9P1Z3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HCN3Q9P1Z3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HCN3Q9P1Z3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HCN3Q9P1Z3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HCN3Q9P1Z3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HCN3Q9P1Z3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HCN3Q9P1Z3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HCN3Q9P1Z3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HCN3Q9P1Z3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HCN3Q9P1Z3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HCN3Q9P1Z3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HCN3Q9P1Z3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HCN3Q9P1Z3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HCN3Q9P1Z3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HCN3Q9P1Z3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HCN3Q9P1Z3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HCN3Q9P1Z3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HCN3Q9P1Z3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HCN3Q9P1Z3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HCN3Q9P1Z3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HCN3Q9P1Z3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HCN3Q9P1Z3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HCN3Q9P1Z3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HCN3Q9P1Z3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HCN3Q9P1Z3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HCN3Q9P1Z3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HCN3Q9P1Z3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HCN3Q9P1Z3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HCN3Q9P1Z3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HCN3Q9P1Z3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HCN3Q9P1Z3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HCN3Q9P1Z3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HCN3Q9P1Z3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HCN3Q9P1Z3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HCN3Q9P1Z3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HCN3Q9P1Z3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HCN3Q9P1Z3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HCN3Q9P1Z3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HCN3Q9P1Z3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HCN3Q9P1Z3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms