Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CXXC1Q9P0U4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CXXC1Q9P0U4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CXXC1Q9P0U4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CXXC1Q9P0U4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CXXC1Q9P0U4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CXXC1Q9P0U4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CXXC1Q9P0U4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CXXC1Q9P0U4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CXXC1Q9P0U4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CXXC1Q9P0U4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CXXC1Q9P0U4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CXXC1Q9P0U4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CXXC1Q9P0U4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CXXC1Q9P0U4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CXXC1Q9P0U4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CXXC1Q9P0U4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CXXC1Q9P0U4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CXXC1Q9P0U4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CXXC1Q9P0U4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CXXC1Q9P0U4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CXXC1Q9P0U4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CXXC1Q9P0U4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CXXC1Q9P0U4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CXXC1Q9P0U4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CXXC1Q9P0U4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CXXC1Q9P0U4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CXXC1Q9P0U4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CXXC1Q9P0U4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CXXC1Q9P0U4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CXXC1Q9P0U4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CXXC1Q9P0U4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CXXC1Q9P0U4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CXXC1Q9P0U4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CXXC1Q9P0U4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CXXC1Q9P0U4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CXXC1Q9P0U4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CXXC1Q9P0U4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CXXC1Q9P0U4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CXXC1Q9P0U4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CXXC1Q9P0U4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CXXC1Q9P0U4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CXXC1Q9P0U4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CXXC1Q9P0U4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CXXC1Q9P0U4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CXXC1Q9P0U4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CXXC1Q9P0U4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CXXC1Q9P0U4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CXXC1Q9P0U4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CXXC1Q9P0U4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CXXC1Q9P0U4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CXXC1Q9P0U4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CXXC1Q9P0U4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CXXC1Q9P0U4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CXXC1Q9P0U4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CXXC1Q9P0U4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CXXC1Q9P0U4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CXXC1Q9P0U4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CXXC1Q9P0U4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CXXC1Q9P0U4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CXXC1Q9P0U4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CXXC1Q9P0U4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CXXC1Q9P0U4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CXXC1Q9P0U4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CXXC1Q9P0U4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CXXC1Q9P0U4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CXXC1Q9P0U4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CXXC1Q9P0U4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CXXC1Q9P0U4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CXXC1Q9P0U4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CXXC1Q9P0U4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CXXC1Q9P0U4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CXXC1Q9P0U4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CXXC1Q9P0U4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CXXC1Q9P0U4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CXXC1Q9P0U4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CXXC1Q9P0U4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CXXC1Q9P0U4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CXXC1Q9P0U4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CXXC1Q9P0U4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CXXC1Q9P0U4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CXXC1Q9P0U4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CXXC1Q9P0U4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CXXC1Q9P0U4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CXXC1Q9P0U4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CXXC1Q9P0U4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CXXC1Q9P0U4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CXXC1Q9P0U4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CXXC1Q9P0U4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CXXC1Q9P0U4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CXXC1Q9P0U4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CXXC1Q9P0U4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CXXC1Q9P0U4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CXXC1Q9P0U4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CXXC1Q9P0U4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CXXC1Q9P0U4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CXXC1Q9P0U4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CXXC1Q9P0U4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CXXC1Q9P0U4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CXXC1Q9P0U4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms